生物加工过程:人工智能时代的智能生物制造
人工智能时代的智能生物制造-生物过程控制
生物过程的多参数在线检测及多尺度理论过程深度学习的基础是广泛大量的在线数据,笔者所在的国家生化工程技术研究中心( 上海) 研究团队,经过几十年的积累,形成了一套基于在线多参数检测系统的过程多参数相关性分析技术及多尺度微生物过程优化理论。
生物反应器中进行的生物过程存在两个不同尺度上的复杂性,第一个是细胞尺度上细胞对外界环境响应的复杂代谢特性; 第二个是反应器内处于湍流状态流动的复杂性,包括混合、传质、传热等的复杂传递特性。总结来说,细胞反应过程是在基因表达、细胞代谢、反应器操作等多个尺度
下多输入、多输出的复杂系统
。
生物反应器中进行的生物过程涉及的变量可归纳,如图所示。图中展示的变量可分成两类: 一类为操作变量、一类为状态变量,也可分为细胞生理特性变量和环境变量。生物过程放大的困难
就来自于这些变量之间复杂的非线性关系,而机器学习可以从复杂的非线性关系中发现规律,从而有可能成为解决过程优化放大的有效工具。在生物过程优化与放大中实施多尺度研究方法包括五个关键步骤: ①系统简化②数据采集,系统 收 集 过 程 变 量 数 据。③数据驱动型研究。 ④子过程分析。⑤各子过程之间量化关系及跨尺度观察。经过以上5 个关键步骤可实现基于细胞代谢流分析与控制为核心的多尺度研究方法。其中,提到数据采集系统及数据驱动型研究即是基于过程大数据的人工智能研究的雏形。实施生物过程参数的在线检测与在线参数的获取是实现生物过程大数据的前提。笔者所在课题组在此方面进行了大量研究与积累在生物反应器上实现了除溶氧( DO) 、pH、温度、压力和液位等常规参数外的多个参数的在线测量,开发了在线活
细胞传感器[34]、在线红外检测[35]、在线电子鼻[36] 和在线尾气质谱[37]等多种可用于生物反应器在线检测的仪器设备,实现了实时在线细胞量、在线尾气O2、尾气CO2、挥发性中间代谢物浓度及在线葡萄糖浓度等多种参数的在线实时采集。基于这些实时在线采集的参数进行了多
个产品的发酵过程优化与放大[38]。在实施生物过程多尺度优化技术的过程中,逐渐意识到生物过程的数据,尤其是在线数据中含有过程中最大量的信息,对这些数据进行分析整理对生物过程的优化放大具有十分重要的意义。通过大量在线检测设备的应用,逐渐形成了不同生物过程的在线大数据系统,如何开发并利用这一宝贵资源变得十分迫切和重要的意义。通过大量在线检测设备的应用,逐渐形成了不同生物过程的在线大数据系统,如何开发并利用这一宝贵资源变得十分迫切和重要。

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碳氮比的概念和优化方法
碳氮比(C/ N) :严格意义上应是指在微生物培养基中所含的碳源中的碳原子摩尔数与氮源中的氮原子摩尔数之比。(周德庆微生物学教程),在这里,我认为对于既能做碳源又能做氮源的物质应该及计算碳源又计算氮源。很多情况我们简单用培养基的碳源和氮源的比值来替代,但这是不准确的。另外由于一些培养基成分中的碳源不易利用,碳氮比也有用还原性碳源和粗蛋白之间的比值来替代,比如下式碳氮比的计算,就是用葡萄糖中的碳元素的摩尔浓度比上总蛋白中氮元素的摩尔质量浓度。
넶4335 2021-09-09 -
【发酵基础】P1,P2,P3,千级、万级和十万级,关于微生物实验室的安全和洁净
넶2608 2020-05-08 -
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【发酵基础】常用灭菌、消毒、除菌和防腐方法及其特征
染菌与控制是发酵圈永远绕不开的话题。降低染菌率是每一个发酵人应该认真学习和考虑的问题。而合理的应用灭菌、消毒和防腐方法是我们必备的技能。这也是我们在详细介绍发酵过程染菌防控之前需要介绍的内容之一。
넶1347 2020-04-29 -
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风波后董宇辉更火,我更加明白:阅读的厚度,决定人生的高度!
넶64 2024-05-03
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关于Western Blot 你想要的都在这里
Western Blot(蛋白质免疫印迹)是细胞与分子生物学领域中常用的核心技术之一,其核心原理是通过凝胶电泳实现蛋白质的分子量分离,再将分离后的蛋白质转移至固相支持膜(如硝酸纤维素膜、PVDF膜),最后利用抗原与抗体的特异性结合反应,实现目标蛋白质的定性与半定量检测。该技术凭借高特异性、高灵敏度的优势,能够从细胞或组织提取的复杂蛋白质混合物中精准识别目标蛋白,为蛋白质相关研究提供直接的实验依据。
从技术本质来看,Western Blot的实现依赖三大关键环节:一是基于分子量的分离,利用SDS-PAGE凝胶的分子筛效应,使不同分子量的蛋白质在电场中呈现不同迁移速率,从而实现分离;二是固相转移,通过电场作用将凝胶中的蛋白质转移至膜上,形成稳定的蛋白印迹;三是特异性标记与检测,借助一抗对目标蛋白的特异性识别和二抗的信号放大作用,结合化学发光、荧光等检测方式,最终实现目标蛋白的可视化。相较于其他蛋白质检测技术,Western Blot兼具分离与鉴定功能,且操作流程相对可控,是生命科学研究中蛋白质分析的基础手段。 -

真菌毒素标准品
真菌毒素,衍生物标准品
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微生物课件
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微生物课件


