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酶制剂等外源蛋白在大肠杆菌体系中的可溶性表达策略

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大肠杆菌表达体系因其表达量高、周期短、成本低等诸多优势特征而被广泛用作重组异源蛋白质的表达宿主。据统计超过30%的重组蛋白质药物和50%重组蛋白质的制备是使用大肠杆菌作为表达宿主。蛋白质错误折叠或未折叠以及包涵体形成是大肠杆菌表达体系更广泛应用的主要阻碍。因此,重组蛋白质在大肠杆菌体系中可溶性表达策略探索意义。

01

 
 
重组蛋白质在大肠杆菌中不可溶性表达 (包涵体形成)的原因
 
在解决不可溶表达前,我们首先需要搞清楚蛋白不可溶,形成包涵体的机制。只有清楚原因,才能对症下药,一步步排查。导致蛋白不可溶表达的机制如下:
  1. 自身氨基酸组成,
    重组蛋白质氨基酸组成中含硫氨基酸及脯氨酸的数量和比例能够显著影响重组蛋白质在大肠杆菌中的 表达形式,含量越高,重组蛋白质更容易形成包涵体。
  2. 亲疏水性强弱,
    蛋白质自身疏水性越强,分子间更容易因 疏水作用引发聚集,使蛋白质错误折叠的概率越大。
  3. 蛋白合成速率,
    由于大肠杆菌的转录和翻译是快速且紧密耦合的,而快速的蛋白质合成速度对具有复杂结构蛋白质的折叠却是致命。
  4. 重组蛋白分子大小及结构复杂程度,
    蛋白分子越大,结果就想对越复杂,后期折叠加工就比较难。研究表明,在大肠杆菌中可溶性表达的概率随着重组蛋白质分子大小的增加而降低,尤其是分子量 >60kDa的 蛋白质,往往在大肠杆菌表达体系中难以以可溶形式表达。
  5. 折叠难易程度,
    重组蛋白质中高级结构类型,特别是二级结构的组成比例能够显著影响蛋白质的折叠速度。有研究表明 α螺旋结构的折叠速度相比于 β发夹结构的折叠速度快近30倍。
  6. 二硫键及数量,
    大肠杆菌胞质处于高度还原性环境中,难以促进重组蛋白质中的半胱氨酸残基氧化形成二硫键,难易使得含有二硫键的蛋白正确折叠。
     

 
 
由上可以看出,影响蛋白可溶性表达的因素分为两类,可将其描述为①蛋白特异性②工艺特异性。除了蛋白合成速率外,其他均属于蛋白特异性,最终是和所表达的外源基因序列有关,因此在分析问题时,可先对蛋白本身的特征进行分析,做到有所针对。
 
 

 

表达系统 优点 缺点
大肠杆菌表达系统
Escherichia coli
表达水平高;
低成本;
简单的培养条件;
生产迅速;
可拓展性强;
转化操作简单;
蛋白表达可以通过多个参数进行优化;
容易形成二硫键
蛋白折叠性较差(包括细菌蛋白);
易形成包涵体;
低效的体外折叠可能抵消优势;
与真核生物不同密码子体系;
很少的翻译后修饰;
内毒素

 

 
 

 

02

 
 
实现重组蛋白可溶性表达策略

根据不可溶表达形成机制,排除不可操作因素,比如蛋白较大,这种情况就只能更换宿主了。可将相应策略分为三类:①改造目的基因②优化表达系统③优化发酵工艺。

1.改造目的基因

由机制可以看出,蛋白本身的特异性是影响其是否可以可溶性表达的关键。因此有必要从基因序列出发进行改造。①密码子偏好性②蛋白结构定向突变③溶标签。

2.表达系统的改造

除了对基因本身的优化外,我们也可以对表达系统进行优化,包括①表达宿主和载体的优化和选择②分子伴侣③分泌表达④大肠杆菌 N-糖基化修饰。对表达系统的不断改造,补齐其短板是解决可溶性表达问题的根本和通用方法。

3.发酵工艺

通过对发酵工艺的优化,也可以在一定程度上提高可溶性表达水平。①诱导温度②IPTG浓度和加入时机(诱导时生物量)③ph值③培养基成分。

 
 

为了提高蛋白质表达水平,促进二硫键形成,提高蛋白质正确折叠,改善蛋白质可溶性表达比例,各种类型的大肠杆菌宿主细胞被设计与改造。常见的大肠杆菌宿主见下表。而表达载体的选择主要是对启动子强度的选择。

 

 

 

 
 

促溶标签融合表达在增加重组蛋白质产率及提高可溶性表达比例等方面具有重要应用意义 。通过促溶标签融合表达能提高目的蛋白质的可溶性表达比例,促进蛋白质正确折叠,但是融合标签的存在会干扰重组表达蛋白质的生物活性。因此最终绝大多数情况下都需要将融合标签去除,在一定程度上也增加了工艺成本。

 

 

 

 
 

通过分子伴侣协助重组蛋白质折叠提升重组蛋白质可溶性表达的方式主要为将分子伴侣基因协同插入在表达载体上,使其与目的基因共表达,应用中常见的策略有单种分子伴侣过表达和多种伴侣系统协同过表达。

 

 

 

03

 
 
蛋白复性

 

 

 

 

 

 

参考文献

[1]苗朝悦, 杜乐, 王佳琦, 陈梓杰, 黄靖倍, 陈且昕, 邹沛璇, 韩笑, 张纯. 重组蛋白质在大肠杆菌体系中的可溶性表达策略*[J]. 中国生物工程杂志, 2023, 43(9): 33-45.

[2]董旭,辛毅.重组蛋白在大肠杆菌中可溶性表达的策略[J].大连医科大学学报, 2007, 29(4):3.DOI:10.3969/j.issn.1671-7295.2007.04.026.

 

 

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2023-11-01
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